Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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SEC23BQ15437 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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SEC23BQ15437 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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SEC23BQ15437 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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SEC23BQ15437 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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