Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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SYCP1Q15431 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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SYCP1Q15431 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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SYCP1Q15431 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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SYCP1Q15431 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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SYCP1Q15431 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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