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| BRD3 | Q15059 | DCN-201 | ENST00000052754 | 7156 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | BRAFP1-201 | ENST00000445336 | 2703 nt | BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | USP44-208 | ENST00000552440 | 1818 nt | TSL 5 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | FGD4-210 | ENST00000525053 | 2925 nt | TSL 2 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC139713.2-215 | ENST00000641428 | 5037 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | DDR2-202 | ENST00000367922 | 10160 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNCA-AS1-201 | ENST00000501215 | 2646 nt | TSL 2 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AP000808.1-201 | ENST00000512200 | 3252 nt | TSL 2 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
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| BRD3 | Q15059 | ENSAP1-201 | ENST00000392855 | 326 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC068533.3-201 | ENST00000435524 | 404 nt | TSL 5 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC004980.3-201 | ENST00000447046 | 365 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
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| BRD3 | Q15059 | RNF148-202 | ENST00000447240 | 839 nt | TSL 2 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC105399.1-202 | ENST00000447303 | 205 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | NCK1-AS1-201 | ENST00000461864 | 1194 nt | TSL 2 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC091180.1-201 | ENST00000462104 | 372 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | NIP7P2-201 | ENST00000485801 | 544 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC007370.1-201 | ENST00000503163 | 316 nt | TSL 2 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC104137.1-201 | ENST00000503625 | 385 nt | TSL 3 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC106872.4-201 | ENST00000510050 | 523 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC00992-202 | ENST00000514186 | 564 nt | TSL 5 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AF181450.1-201 | ENST00000522980 | 410 nt | TSL 3 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC006206.2-202 | ENST00000537714 | 648 nt | TSL 5 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
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| BRD3 | Q15059 | MIR762HG-201 | ENST00000564901 | 648 nt | TSL 2 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP005059.1-201 | ENST00000578391 | 456 nt | TSL 2 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC079070.1-201 | ENST00000578740 | 555 nt | TSL 2 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC114684.1-201 | ENST00000587659 | 352 nt | TSL 3 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | UBL5-207 | ENST00000590068 | 390 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | SUGT1P3-202 | ENST00000604259 | 383 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC115621.1-201 | ENST00000604653 | 858 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC110609.1-201 | ENST00000608228 | 303 nt | TSL 3 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC009974.1-201 | ENST00000608881 | 455 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC079395.2-201 | ENST00000610982 | 737 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | SYNJ2BP-COX16-205 | ENST00000621525 | 929 nt | APPRIS P2 TSL 2 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC068787.1-201 | ENST00000623908 | 691 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | UGP2-231 | ENST00000627474 | 264 nt | TSL 5 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | LANCL1-204 | ENST00000441020 | 4503 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | CDH17-201 | ENST00000027335 | 3693 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | HSPA8P18-201 | ENST00000439846 | 1928 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | CLSPN-206 | ENST00000520551 | 4010 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| BRD3 | Q15059 | PTPN22-201 | ENST00000359785 | 3654 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | CREM-206 | ENST00000354759 | 1589 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | FOXP2-220 | ENST00000634411 | 4065 nt | TSL 5 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | UBA6-AS1-203 | ENST00000500538 | 3352 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR6C2-202 | ENST00000641202 | 2105 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | CYLD-212 | ENST00000568704 | 3292 nt | TSL 5 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC006994.2-202 | ENST00000639259 | 3828 nt | TSL 5 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZCCHC7-202 | ENST00000336755 | 2619 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | MPHOSPH9-211 | ENST00000541076 | 6136 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC01355-201 | ENST00000566551 | 5444 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC099786.3-201 | ENST00000565735 | 1410 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | FAM26D-201 | ENST00000368596 | 1353 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR4K1-203 | ENST00000641429 | 1358 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL122126.1-201 | ENST00000546905 | 1318 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF705D-202 | ENST00000400085 | 3377 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU1-94P-201 | ENST00000362627 | 173 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU1-85P-201 | ENST00000364127 | 164 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | AMELX-202 | ENST00000380712 | 835 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | AMELX-203 | ENST00000380714 | 793 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | HSPA8P15-201 | ENST00000401676 | 786 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR4K12P-201 | ENST00000406538 | 961 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | SLC19A3-202 | ENST00000409287 | 644 nt | TSL 3 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL162394.1-201 | ENST00000413271 | 419 nt | TSL 2 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC005104.1-201 | ENST00000414896 | 442 nt | TSL 3 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC007435.1-201 | ENST00000421086 | 415 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC073641.1-201 | ENST00000425192 | 429 nt | TSL 3 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC01445-201 | ENST00000426205 | 812 nt | TSL 3 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC096632.1-201 | ENST00000427395 | 310 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | MTND2P5-201 | ENST00000432656 | 1006 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | Z80107.1-201 | ENST00000436830 | 412 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
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| BRD3 | Q15059 | Z80107.2-201 | ENST00000445127 | 392 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC002383.1-201 | ENST00000448260 | 671 nt | TSL 5 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL645937.3-201 | ENST00000453647 | 936 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC034195.1-203 | ENST00000455703 | 728 nt | TSL 2 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC005008.1-201 | ENST00000456151 | 612 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |