Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 319.8 ms