Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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