Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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