Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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CDH18Q13634 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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CDH18Q13634 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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CDH18Q13634 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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