Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CHAF1AQ13111 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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