Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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PTP4A2Q12974 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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PTP4A2Q12974 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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PTP4A2Q12974 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTP4A2Q12974 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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