Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms