Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC079777.1-201ENST00000623836 1953 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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