Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD3Q12873 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD3Q12873 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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