Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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E2F1Q01094 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
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E2F1Q01094 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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