Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CENPFP49454 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
CENPFP49454 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CENPFP49454 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
CENPFP49454 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
CENPFP49454 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
CENPFP49454 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
CENPFP49454 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
CENPFP49454 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
CENPFP49454 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CENPFP49454 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CENPFP49454 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CENPFP49454 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CENPFP49454 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CENPFP49454 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CENPFP49454 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CENPFP49454 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CENPFP49454 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CENPFP49454 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CENPFP49454 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CENPFP49454 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms