Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRDP23468 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRDP23468 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
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