Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRAP18433 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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