Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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ARL2-SNX15V9GYD0 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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