Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms