Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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CCDC142Q17RM4 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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CCDC142Q17RM4 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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CCDC142Q17RM4 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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