Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 TFDP2-224ENST00000499676 9335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
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LAMA3Q16787 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
LAMA3Q16787 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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LAMA3Q16787 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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LAMA3Q16787 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LAMA3Q16787 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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