Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 GABRA6-201ENST00000274545 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC096922.1-201ENST00000461635 651 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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