Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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COL4A6Q14031 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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COL4A6Q14031 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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COL4A6Q14031 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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COL4A6Q14031 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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COL4A6Q14031 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL4A6Q14031 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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