Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 EFCAB7-201ENST00000371088 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 SEMA3C-203ENST00000419255 2415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 FAM19A2-211ENST00000550003 2499 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 TIMM21-204ENST00000580087 2524 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 LRRC4C-202ENST00000527150 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 RECQL-203ENST00000421138 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 CFAP47-201ENST00000297866 3608 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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FOXC1Q12948 KIF21A-204ENST00000544797 5040 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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FOXC1Q12948 CFAP57-201ENST00000372492 4244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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FOXC1Q12948 SLC15A1-202ENST00000376503 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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FOXC1Q12948 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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FOXC1Q12948 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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FOXC1Q12948 SLC11A2-203ENST00000394904 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 FCGR3B-202ENST00000367964 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 NQO1-201ENST00000320623 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 DAPP1-201ENST00000296414 2955 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 SYTL4-204ENST00000372989 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 ZNF674-207ENST00000523374 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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