Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PDE4DQ08499 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PDE4DQ08499 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms