Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM3AP98173 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms