Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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PTPRMP28827 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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PTPRMP28827 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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PTPRMP28827 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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PTPRMP28827 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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PTPRMP28827 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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PTPRMP28827 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRMP28827 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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