Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Msrb1Q9JLC3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Msrb1Q9JLC3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms