Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem3Q9JKE1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms