Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms