Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms