Protein–RNA interactions for Protein: Q96MI9

AGBL1, Cytosolic carboxypeptidase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL1Q96MI9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGBL1Q96MI9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms