Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF428Q96B54 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF428Q96B54 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF428Q96B54 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF428Q96B54 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF428Q96B54 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF428Q96B54 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF428Q96B54 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF428Q96B54 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms