Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCC1Q92922 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms