Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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