Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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