Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Bhlhe22Q8C6A8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe22Q8C6A8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms