Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX8Q68G74 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX8Q68G74 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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