Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms