Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trp53i11Q4QQM4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Trp53i11Q4QQM4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Trp53i11Q4QQM4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Trp53i11Q4QQM4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Trp53i11Q4QQM4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Trp53i11Q4QQM4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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