Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp3Q3ULW8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms