Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP6Q16828 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms