Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA6Q16445 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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GABRA6Q16445 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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GABRA6Q16445 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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GABRA6Q16445 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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GABRA6Q16445 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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GABRA6Q16445 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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