Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA2Q15822 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms