Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
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