Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF1Q13077 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
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