Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms