Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelpQ01102 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SelpQ01102 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SelpQ01102 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SelpQ01102 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SelpQ01102 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SelpQ01102 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SelpQ01102 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SelpQ01102 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SelpQ01102 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SelpQ01102 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SelpQ01102 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelpQ01102 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SelpQ01102 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms