Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RHBDL3P58872 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL3P58872 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms