Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL23P55773 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL23P55773 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL23P55773 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL23P55773 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL23P55773 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL23P55773 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL23P55773 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL23P55773 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL23P55773 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL23P55773 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL23P55773 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL23P55773 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL23P55773 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL23P55773 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL23P55773 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL23P55773 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL23P55773 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL23P55773 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL23P55773 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL23P55773 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL23P55773 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL23P55773 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL23P55773 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL23P55773 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL23P55773 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL23P55773 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL23P55773 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL23P55773 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL23P55773 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL23P55773 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL23P55773 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL23P55773 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL23P55773 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL23P55773 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL23P55773 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL23P55773 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL23P55773 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL23P55773 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL23P55773 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL23P55773 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL23P55773 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL23P55773 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL23P55773 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL23P55773 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL23P55773 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL23P55773 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL23P55773 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL23P55773 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL23P55773 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL23P55773 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL23P55773 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL23P55773 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL23P55773 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL23P55773 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL23P55773 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL23P55773 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL23P55773 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL23P55773 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL23P55773 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL23P55773 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL23P55773 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL23P55773 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL23P55773 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL23P55773 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL23P55773 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL23P55773 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL23P55773 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL23P55773 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL23P55773 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL23P55773 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL23P55773 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms