Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM5CP41229 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM5CP41229 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM5CP41229 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM5CP41229 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM5CP41229 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM5CP41229 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM5CP41229 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM5CP41229 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM5CP41229 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM5CP41229 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM5CP41229 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM5CP41229 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM5CP41229 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM5CP41229 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM5CP41229 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM5CP41229 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5CP41229 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms