Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPS1P31327 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPS1P31327 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPS1P31327 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CPS1P31327 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPS1P31327 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPS1P31327 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPS1P31327 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPS1P31327 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPS1P31327 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPS1P31327 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPS1P31327 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPS1P31327 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPS1P31327 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPS1P31327 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPS1P31327 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPS1P31327 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPS1P31327 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPS1P31327 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPS1P31327 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPS1P31327 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPS1P31327 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPS1P31327 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPS1P31327 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CPS1P31327 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPS1P31327 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPS1P31327 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CPS1P31327 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPS1P31327 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPS1P31327 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPS1P31327 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPS1P31327 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPS1P31327 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPS1P31327 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPS1P31327 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPS1P31327 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPS1P31327 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPS1P31327 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPS1P31327 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPS1P31327 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPS1P31327 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CPS1P31327 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPS1P31327 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPS1P31327 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPS1P31327 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPS1P31327 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPS1P31327 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPS1P31327 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPS1P31327 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPS1P31327 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPS1P31327 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPS1P31327 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPS1P31327 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPS1P31327 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPS1P31327 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPS1P31327 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPS1P31327 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPS1P31327 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPS1P31327 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPS1P31327 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CPS1P31327 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CPS1P31327 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPS1P31327 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPS1P31327 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPS1P31327 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPS1P31327 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPS1P31327 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPS1P31327 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPS1P31327 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPS1P31327 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CPS1P31327 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CPS1P31327 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPS1P31327 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPS1P31327 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPS1P31327 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CPS1P31327 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPS1P31327 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPS1P31327 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPS1P31327 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPS1P31327 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPS1P31327 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPS1P31327 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPS1P31327 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPS1P31327 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPS1P31327 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPS1P31327 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPS1P31327 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPS1P31327 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPS1P31327 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPS1P31327 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPS1P31327 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPS1P31327 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPS1P31327 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPS1P31327 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPS1P31327 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPS1P31327 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPS1P31327 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPS1P31327 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPS1P31327 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPS1P31327 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms